特殊雜質(zhì)是指在該藥物的生產(chǎn)和貯存過程中，根據(jù)藥物的性質(zhì)、生產(chǎn)方式和工藝條件，有可能引入的雜質(zhì)。這類雜質(zhì)隨藥物的不同而異。由于特殊雜質(zhì)多種多樣，檢查方法各異，故一般將其分成以下幾類：
 一、物理法
利用藥物與雜質(zhì)在嗅、味、揮發(fā)性、顏色、溶解及旋光性等上的差異，檢查所含雜質(zhì)是否符合限量規(guī)定。
二、化學反應法
 （一）容量分析方法：利用藥物與雜質(zhì)在酸堿性及氧化還原性等方面的差異，用標準溶液滴定來測定雜質(zhì)含量。
 （二）重量分析方法：在一定實驗條件下測定遺留物重量。
 （三）比色法和比濁法：利用雜質(zhì)特有的呈色反應（比色法）和沉淀反應（比濁法）與標準對照。
三、色譜法
 （一）紙色譜法（Paper Chromatography，P.C）
取一定量供試品溶液雜質(zhì)限量對照品溶液，于同一色譜濾紙上點樣，展開，檢出后，比較雜質(zhì)斑點的個數(shù)、顏色深淺或熒光強度等。通常用于極性較大的藥物或放射性藥物的檢查。醫(yī)學教育|網(wǎng)搜集整理該法展開時間長、斑點較為擴散、不能用強酸等腐蝕性顯色劑。
 （二）薄層色譜法（Thin Layer Chromatography，TLC）

類似紙色譜法，但較簡便、快速、靈敏、不需特殊設備，適用于有機雜質(zhì)的檢查。另外，一般將與主藥有密切相關的原料、中間體、副產(chǎn)物或分解產(chǎn)物等特殊雜質(zhì)稱為有關物質(zhì)，將甾體類藥物中的特殊雜質(zhì)稱為其它甾體。TLC法按操作方法又可歸納為如下幾種情況：

1、在一定供試品及檢查條件下，不允許有雜質(zhì)斑點存在。

 2、選用實際存在的待檢雜質(zhì)作為雜質(zhì)對照品。
 3、選用可能存在的某種雜質(zhì)作為雜質(zhì)對照品。
 4、將供試品稀釋到適當濃度作為雜質(zhì)對照溶液。
 5、選用質(zhì)量符合規(guī)定的與供試品相同的藥物作為雜質(zhì)對照品。
 （三）高效液相色譜法（High Performance Liquid Chromatography，HPLC）：本法分離效能高、性強和檢測靈敏，適用于有機雜質(zhì)，但更多地用于含量測定。
 （四）氣相色譜法（Gas Chromatography，GC）：主要用于揮發(fā)性有機雜質(zhì)和有機溶劑殘留量的檢查。
 1、揮發(fā)性有機雜質(zhì)測定方法：
（1）面積歸一化法：計算各雜質(zhì)峰面積及其總和，并求出占總峰面積的百分率，但溶劑峰不計算在內(nèi)。
 （2）主成分自身對照法：先按供試品規(guī)定的雜質(zhì)限度，將供試品稀釋成一定濃度的溶液，作為對照溶液，進樣，調(diào)節(jié)檢測器的靈敏度或進樣量，使對照溶液中的主成分色譜面積滿足準確測量要求。然后取供試品溶液，進樣，記錄時間，一般應為主成分保留時間的倍數(shù)。根據(jù)測得的供試品溶液的各雜質(zhì)峰面積及其總和并與對照溶液主成分的峰面積比較，計算雜質(zhì)限度。
 （3）內(nèi)標法測定雜質(zhì)總量限度：供試品按各品種項下規(guī)定的方法配制不含內(nèi)標物質(zhì)的供試品溶液，注入儀器，記錄色譜圖I；再配制含有內(nèi)標物質(zhì)的供試品溶液，同法記錄色譜圖II.如果圖I中沒有與圖II上內(nèi)標峰保留時間相同的雜質(zhì)峰，則圖II中各雜質(zhì)面積之和應小于內(nèi)標物質(zhì)峰面積（溶劑峰不計在內(nèi)）。
 （4）內(nèi)標法加校正因子測定供試品中某個雜質(zhì)（或主成分）含量。
 （5）外標法測定供試品中某個雜質(zhì)（或主成分）含量。